产品简介
FFPE样本由于组织或细胞进行了固定造成了RNA断裂，所以常规真核生物通过polyA尾捕获mRNA的方式不适用于FFPE样本的转录组测序，“旭燃生物”FFPE样本转录组测序采用去rRNA的方式进行建库，和常规lncRNA测序的建库原理比较相似。但是FFPE样本天然存在降解，样本RNA片段异质性比较大，“旭燃生物”对实验条件进行了优化，以便得到高质量的数据。
数据表现
产品优势
1、可同时检测mRNA、lncRNA和circRNA
2、可适用于FFPE等RNA质量稍差的样本
3、低成本，高准确性，大幅降低了测序时间
4、数字化信号，直接测定每个转录本片段序列,单核苷酸分辨率的精确度
5、利用高深度的测序数据组装构建转录本序列,识别可变剪接模式
实验流程
数据分析
| 样本类型 | 建议送样量 | 存储介质 | 保存、运输条件 |
| 组织 | ＞50mg | 1.RNA later； 2.存入冻存管; 3.大块组织样本不建议放入trizol保存； 4.1.5ml无菌离心管 | -80℃保存，干冰运输 |
| 细胞 | ＞2 x 10^6 | 1.收集的细胞沉淀，加入1ml trizol震荡混匀-80度保存； 2.收集的细胞沉淀，液氮速冻5-10min，-80℃冰箱保存； | -80℃保存，干冰运输 |
| 全血 | ＞1ml | A.采用EDTA抗凝管采血，禁用肝素抗凝管，新鲜血液效果更佳。 B.或者分离出PBMC加 trizol 混匀。 C.或者全血离心去掉血浆加 trizol 混匀。 D.或者使用PAXgene Blood RNA Tube静脉真空采血管（全血RNA管） PS：请尽量不使用RNA later保存全血。 | -80℃保存，干冰/4度（新鲜）运输 |
| FFPE | A.切片组织面积大于1cm2，切片表面无划痕，无干裂，均匀贴片的石蜡切片； B.切片组织细胞>30000个；有核细胞比例>80%；肿瘤细胞比例>20%，白片厚度5~ 10um，需3-5片，组织面积偏小或细胞核占比未达80%以上，需提供5-12片； C.石蜡块：厚度4mm以上，组织约绿豆大小以上； D.蜡卷：厚度25um左右，2-5卷 | / | 4℃或常温保存和运输 |
| RNA | ＞1ug | DEPC水；Water Nuclease-Free | -80℃保存，干冰运输 |
研究方向/思路
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