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Small RNA测序
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  • 产品描述

    小RNA(Small RNA)是一类长度在18-30nt的内源性RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA等,是生命活动重要的调控因子,在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。Small RNA测序(Small RNA-seq)是利用第二代高通量测序技术,对特定状态下细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序,实现Small RNA序列的鉴定、靶基因分析和功能注释等多项分析。

    产品优势
    1、通量高、敏感性高的技术,对于多基因分析及低频突变检测具有独特的优势
    2、全基因组分析,无需预先设计特异性探针能够检测未知基因

    3、低成本,高准确性,大幅降低了测序时间
    4、数字化信号直接测定每个转录本片段序列,单核苷酸分辨率的精确度
    5、高深度的测序数据,检测新的miRNA

    实验流程

  • 数据分析

  • 样本类型建议送样量存储介质保存、运输条件
    组织>50mg1.RNA later;
    2.存入冻存管;
    3.大块组织样本不建议放入trizol保存
    4.1.5ml无菌离心管
    -80℃保存,干冰运输
    细胞>2 x 10^61.收集的细胞沉淀,加入1ml trizol震荡混匀-80度保存;
    2.收集的细胞沉淀,液氮速冻5-10min,-80℃冰箱保存;
    -80℃保存,干冰运输
    全血>1mlA.采用EDTA抗凝管采血,禁用肝素抗凝管,新鲜血液效果更佳。
    B.或者分离出PBMC加 trizol 混匀。
    C.或者全血离心去掉血浆加 trizol 混匀。
    D.或者使用PAXgene Blood RNA Tube静脉真空采血管(全血RNA管)
    PS:请尽量不使用RNA later保存全血。
    -80℃保存,干冰/4度(新鲜)运输
    FFPEA.切片组织面积大于1cm2,切片表面无划痕,无干裂,均匀贴片的石蜡切片;
    B.切片组织细胞>30000个;有核细胞比例>80%;肿瘤细胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,组织面积偏小或细胞核占比未达80%以上,需提供5-12片;

    C.石蜡块:厚度4mm以上,组织约绿豆大小以上;
    D.蜡卷:厚度25um左右,2-5卷
    /4℃或常温保存和运输
    RNA>1ugDEPC水;Water Nuclease-Free-80℃保存,干冰运输
  • 研究方向/思路

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