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Bulk ATAC测序
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  • 产品描述

    ATAC-Seq技术的原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性,然后对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序。DNA转座,是一种把DNA序列从染色体的一个区域搬运到另外一个区域的现象,由DNA转座酶来实现。这种转座插入DNA,也是需要插入位点的染色质是开放的,否则就会被高级结构给卡住。
    转座酶可以随机结合并切割染色质开放区的DNA,并且可同时在切割位点插入接头序列。如下图,只要将携带已知DNA序列标签的转座复合物(即带红色和蓝色序列标签的Tn5转座酶)加入到细胞核中一起孵育,再利用已知序列标签进行PCR扩增即可形成文库,经过测序就可以获得染色质开放区的信息。

    产品优势

    1、灵敏度高,细胞起始量低;
    2、操作更简单,优化建库、耗时短;
    3、技术重复性强、成功率高;
    4、检测基因组组蛋白修饰、转录因子、转录调控子结合位点;
    5、分析结果可视化,图形化的展示peak的富集情况

    实验流程

  • 数据分析

  • 样本类型建议送样量存储介质保存、运输条件
    冻存细胞>20 w1.将细胞重悬与冻存液(50% FBS+40%完全培养基+10% DMSO)中,每个冻存管加入≥20万细胞
    2.将冻存管(标记样本名)放入程序降温盒中,放入-80度冰箱,降温6-24H后即可准备运输
    -80℃冰箱保存,干冰运输
    新鲜细胞>10 w10%FBS常用培养基运输时使用碎冰4°运送,新鲜细胞悬液尽可能在4h内送达
    动物组织>30 mg/液氮速冻30min 后放于-80℃保存;干冰运输
    植物叶片≥0.5g;茎≥1 g;根≥1 g/液氮速冻样本,然后用预冷的锡箔纸包裹储存在-80°C,干冰运输
  • 研究方向/思路

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