基因组重测序(Re-Sequencing)是对已知基因组序列信息的个体进行测序,可在此基础上对个体或群体进行基因型差异性分析。主要用于发现大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(Copy Number Variation,CNV)、插入缺失(InDel,Insertion/Deletion)等变异位点,以高效准确获得生物群体的遗传特征,并方便进行全基因组关联性分析(GWAS),在人类疾病和动植物育种研究等方面意义重大。
1、分析方法灵活,快速鉴定多种类型的遗传变异
2、全基因组分析,揭示个体的全部基因组序列,包括基因和非编码区域
3、低成本,高准确性,高通量
4、实验及分析周期短,快速地确定生物体的完整基因组序列
样本类型 | 建议送样量 | 保存、运输介质 |
组织 | >50mg | -80℃保存,干冰运输 |
细胞 | >2 x 10^6 | -80℃保存,干冰运输 |
血液 | >1ml | -80℃保存,干冰/4度(新鲜)运输 |
FFPE | A.切片组织面积大于1cm2,切片表面无划痕,无干裂,均匀贴片的石蜡切片; B.切片组织细胞>30000个;有核细胞比例>80%;肿瘤细胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,组织面积偏小或细胞核占比未达80%以上,需提供5-12片; C.石蜡块:厚度4mm以上,组织约绿豆大小以上; D.蜡卷:厚度25um左右,2-5卷 | 4℃或常温保存和运输 |
唾液 | >1ml,尽量收集较多的细胞 | 常温或4℃运输 |
口腔拭子 | 1.5ml管 2管,或5ml管1管 | 常温或4℃运输 |
gDNA | >1ug | -80℃保存,干冰运输 |