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RNA原位测序(ISS)
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  • 技术原理

    技术原理 原位测序技术 (In Situ Sequencing,ISS) 依赖于双连接和滚环扩增技术,它是以缺口靶向(Gap-targeted Sequencing) 或条形码靶向 (Barcode-targeted Sequencing) 为测序策略,同时引入边连接边测序的化学原理(Sequencing-by-ligation Chemistry),以滚环扩增产物为测序媒介进而在组织或细胞原位对RNA实现短片段测序的技术。

    技术流程

    (1)定制探针:针对用户提供的基因的非保守区设计探针并合成

    (2)样本前处理:将冰冻切片退冻、固定、脱水和透化,以便探针和反应所需的酶等成分进入组织细胞内部

    (3)探针杂交与滚环扩增:探针与RNA杂交,之后连接成环;通过滚环扩增反应放大编码信号

    (4)原位成像:利用边合成边测序的化学原理,通过采集荧光信号得到对应位置的编码碱基;经过序列解码,可识别出该位置靶向结合的基因

    (5)图像分析:获得每个靶基因在组织中的空间表达位置,用不同符号(或颜色)标记在同一张组织图像中;通过细胞边界识别等方法得到单细胞水平的基因表达定量数据,可进行高级分析

    产品优势

    (1)高效、特异、高敏

    (2)高信噪比

    (3)可实现256种靶标分子检测

    (4)亚细胞分辨率

    技术优势

  • 检测结果展示
    分析流程/内容


    1. 冷冻组织OCT包埋样本或者切片
    2. 石蜡包埋组织样本或者切片(FFPE样本) 
    3. 细胞爬片样本等
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