技术原理

1. 空间位置标记 Visium HD的空间基因表达芯片有2个捕获区。每个捕获区域为6.5x6.5mm。捕获区有~1100万个基因表达spot点,每个点包括标记空间位置的Spatial Barcode,以追溯RNA来源位置信息。
2. 全基因组探针捕获 同单细胞Fixed RNA方案,Visium HD空转也使用全基因组探针靶向杂交捕获的方式,探针由左右臂组成,只有左右臂同时靶定目的区域才能进行连接被胶珠上的Poly(dT)VN捕获。
基于以上两点,单链连接产物在RNase处理和透化后从组织中释放出来,然后在空转载玻片上被捕获。一旦连接产物被捕获,探针经过延伸后被添加上UMI、Spatial Barcode和Read1T。最终生成带有空间条形码的探针产物,继续用于测序文库的制备。
注意事项 暂时仅可支持人和小鼠,若需要做其他物种,可联系我们做新鲜速冻组织空转(一代)。
实验流程
产品优势

研究方向
