单细胞ATAC测序简介
染色质转座酶可及性测序(ATAC-Seq)是确定全基因组范围内的染色质可及性的常 用方法。 ATAC-Seq可以对开放的染色质区 域进行测序,并以此来了解染色质包装和其他因素如何影响基因的表达。
实验原理
进行ATAC-Seq时,基因组DNA会暴露在高 活性转座酶Tn5中。 Tn5会优先插入到开放染 色质位点,使DNA片段化,并同时添加测序 引物(该过程名为转座酶片段化)。测序的 DNA即代表开放的染色质,可通过数据分析 深入了解基因调控。此外, ATAC-Seq还可 以与RNA测序等其他方法相结合,作为多组 学方法来研究基因的表达
实验流程
数据性能
1.敏感性和特异性高
2.重现性高