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单细胞ATAC测序（scATAC-seq）是基于10x genomics平台的微流控和油滴包裹技术，在单细胞水平对细胞染色质开放区域进行检测的新技术，可用于绘制细胞染色质开放区的单细胞图谱，是一种高分辨率研究染色质开放程度与DNA结合蛋白调控基因的表达网络，在单细胞水平研究表观遗传学的有效手段。
染色质可及性的早期研究技术是ATAC-seq(Assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing)，该技术可进行高通量测序的染色质可及性(开放性)研究。10x Genomics 推出的 Chromium 单细胞 ATAC 解决方案提供了一种全面的、可扩展的方法来研究分析单个样本中成百上千个细胞中染色质的开放情况。可在单细胞水平进行多组学联合分析，深度挖掘细胞异质性表观遗传调控机理。

高通量的细胞捕获，适用于细胞系、原代细胞、新鲜组织和冻存样本的研究；
单细胞水平揭示细胞核内染色质可接近性的差异；
鉴定细胞类型特异的转录因子，深入研究转录调控网络；
技术重复性强、成功率高;