科研服务Services

产品描述

单细胞Fixed RNA为10x Genomics于2022年3月推出的新产品，采用4%的PFA对细胞进行固定，锁定RNA的表达状态，建库时通过探针杂交捕获基因，可覆盖18,000多个基因，解决了单细胞样本储存、多样本批量处理以及混样测序的问题，让单细胞转录组的研究更加灵活。
    Fixed RNA可以保留脆弱细胞或动态的生物学状态，将分析扩展到更多样本，样本固定后集中处理，在同一次运行中批量操作实验和分析，最大限度减少实验可变性和批次效应，单通道中最多可混16个样品，每个样本捕获8,000-10,000细胞，单张芯片最多可混128个样本，最多可得1,024,000个细胞，混样大大降低实验成本。

产品优势

• 扩大了样本范围：能对FFPE细胞和组织，以及PFA固定样本进行单细胞测序分析，而不再受限于是否有新鲜组织可用，可以解锁大量储存在医院以及生物样本库中的 FFPE 样本的宝贵信息。

• 提升了低表达基因检测灵敏度：特异性的探针设计，根据Flex和3’转录组的实测对比数据结果，在多种样本类型中，相同的测序数据量下，Flex所得的测序数据饱和度更高，探针灵敏度更强，单个细胞内可以检测到的基因数更多。

• 减少了样本采集运输难度：采集方面，样本的及时固定，可使取样更灵活，扩散到多个采集点的同时减少取样时间限制。运输方面，长距离运输的压力变小，也适合多中心合作的应用场景。

• 降低批次效应：对于获取时间不规律的肿瘤样本、发育生物学中同一来源不同时间点的样本、治疗预后相关的临床样本等场景中样本分批次采集的情况，可以应用Flex同批次进行杂交建库实验。实验梯度设置更准确，同时降低结果可变性。

• 锁定瞬时表达：对于异质性较强，生物学状态快速变化的样本，其细胞离体后，可能会受到较多外界压力和影响，Flex经过PFA及时固定，已经锁定了样本瞬时的表达状态。非常适合濒死样本、多阶段变化样本、脆弱样本、需先进行病理分型的样本等。

• 方便与Cytassist空转联合分析：Flex技术与Visium Cytassist空转技术结合，通过同一套探针对同一FFPE样本进行单细胞转录组和空间转录组研究，基因表达一致性更高，数据联合分析匹配性更好。

实验流程